Recouvrement des restes des princes :
Des investigations sont effectuées en 1810 auprès des fossoyeurs pour connaître la destination des restes, il résulte plusieurs destinations : une grande partie des restes des princes ont été transportés au cimetière de Boudonville, les corps trop peu consumés ont été enterrés en profondeur dans la crypte même (exemple : Léopold I) et que les urnes sont restés intacte.
En 1817 une commission est créée pour retrouver et remettre les cendres des princes de Lorraine dans la crypte de la chapelle ronde, tout cela s'est fait en plusieurs étapes :
le 19 octobre 1826, les commissaires vont dans la chartreuse de Bosserville, dans le cimetière et font ouvrir la fosse où on été déposés les restes de Charles IV et son fils le prince de Vaudémont, leurs restes sont placés dans un coffre puis amené dans la cathédrale de Nancy. Dans cette même chartreuse derrière l'autel se trouvait une armoire où se trouvait les cœurs de Charles IV, du Prince de Vaudémont et son épouse Anne-Elisabeth de Lorraine, les cœurs sont placés aussi dans la cathédrale de Nancy.
Exhumation des restes des princes dans le cimetière de Boudonville le 20 octobre, leurs cendres sont déposés dans 5 cercueils de sapin eux-mêmes placés dans des cercueils de chêne puis transportés dans la cathédrale de Nancy.
le 21 octobre un petit coffre fut placé dans la cathédrale, il contenait les restes de Gérard I comte de Vaudémont, ces cendres furent retrouvées lors de la démolition de l'église Saint-Léopold en 1822.
le 21 octobre on enlève dans le caveau de l'église de Bonsecours une boite contenant le coeur de Henri de Lorraine marquis de Hattonchatel, ce coeur fut retrouvé en 1811 dans l'église des Minimes et ensuite déposé dans la crypte de l'église de Bonsecours en 1814.
Encore le 21 octobre le maire de Nancy fait transporter une boite contenant le coeur de Camille de Lorraine mort en 1715, le coeur avait été placé dans l'abbaye de Royaumont et retrouvé en juin 1826 puis envoyé à Nancy.
Les restes sauvés par le docteur Simonin parmi eux les crânes duc duc Mathieu Ier, du duc Raoul, de Ferry IV et de Eric de Lorraine évêque de Verdun, les cœurs de François II, de Christine de Salm et de sa mère Marie Le Veneur et aussi plus 278 os et 190 restes d'os et quelques cheveux, d'étoffe de soie et morceaux de fer et de plomb provenant de la crypte des ducs. Tous ces restes sont déposés dans la cathédrale de Nancy.
Cérémonie du 09 novembre 1826 :
- 5 cercueils et 6 caisses sont transportées dans la crypte de la chapelle ducale, sur chacun des cercueils une inscription est placée :
Dépouilles mortelles des très-hauts, très-puissants et très-excellents princes et princesse de l'auguste maison de Lorraine, inhumés au caveau ducal des Cordeliers, antérieurement à l'année 1792.Arrachés de cet asile que des mains sacrilèges avaient violé au mois de décembre 1793, elles furent déposées dans une fosse du cimetière de Boudonville, d'où leur exhumation a eu lieu le 20 octobre 1826, et le 9 novembre suivant, elles ont été solennellement réintégrées dans le caveau ducal, par la pieuse sollicitude du roi Charles X et de l'empereur François I, et par les soins du marquis de Foresta et du baron de Vincent, commissaires respectif de LL. MM. très-chrétienne et apostolique.
- caisse contenant les restes trouvés à Bosserville avec l'inscription suivante :
Dépouilles mortelles des très-hauts, très-puissants et très-excellents princes Charles IV du nom, duc de Lorraine et de Bar, et de Charles-Henri de Vaudémont, son fils, inhumés l'un et l'autre dans un caveau de l'église de la chartreuse de Bosserville.
Transférés en 1798 dans le cimetière de ce même monastère, elles en ont été retirées le 19 octobre 1826, et le 9 novembre suivant elles ont été déposées dans le caveau ducal des Cordeliers, par les soins du marquis de Foresta et du baron de Vincent, commissaires respectifs de LL. MM. le roi de France et l'empereur d'Autriche.
- boite renfermant les ossements sauvés par le docteur Simonin avec inscription :
Dépouilles mortelles, etc. ; comme sur les cercueils.
Une main pieuse les en ayant retirées en décembre 1793, dans la vue de les soustraire à la profanation ; elles y ont été solennellement réintégrées le 9 novembre 1826, par les soins, etc.
- caisse contenant des boites de plomb avec inscriptions :
Dépouilles mortelles de très-hauts, etc
Cœurs du duc François II, de Christine de Salm, son épouse, et de Marie Le Veneur, mère de la duchesse Christine, inhumée au milieu du sanctuaire de l'église paroissiale de Notre-Dame de Nancy. Une main pieuse les en retire à l'époque de la destruction de ce monument et le 9 novembre 1826, ils on été déposés dans le caveau ducal par les soins, etc.
- caisse contenant 2 boites de plomb avec inscription :
Dépouilles mortelles de très-hauts, etc.
Coeur du prince Henri et du prince Camille
Le premier, fils aîné de François de Lorraine, comte de Vaudémont, et de Christine de Salm, son épouse, mort en bas âge, au mois de mai 1611, inhumé dans l'église des Minimes de Nancy, d'où il fut transféré en 1814 dans celle de Bon-Secours.
Le second fils du prince Louis de Lorraine, grand écuyer de France, mort en 1715, et inhumé dans l'abbaye de Royaumont, sous les décombres de laquelle il a été retrouvé le 3 juin 1826.
L'un et l'autre déposés dans le caveau ducal des Cordeliers, par les soins, etc.
Les ossements de René II ont été replacés dans leur caveau particulier en 1818 dans un linceul puis le 4 mars 1830 dans une caisse de chêne avec inscription.
1856 - Transfert dans la crypte des cercueils de Henri de Lorraine comte d'Harcourt, Louis de Lorraine comte d'Armagnac et de François-Armand de Lorraine évêque de Bayeux. Leurs cercueils furent retrouvés vers 1830 dans les caveaux de l'ancienne église de l'abbaye de Royaumont.
12 novembre 1856 dépôts des ossements d'Anne Elisabeth de Lorraine retrouvés le 25 octobre dans l'ancien cloitre des Carmélites de Pont-à-Mousson
1867 - Des fouilles sont effectuées dans les sépultures du cardinal de Vaudémont et des ducs de Mercoeurs, plusieurs ossements sont retrouvés éparpillés dans les caveaux (crânes, mâchoires, cheveux, restes de plomb, tibias etc..) et placés dans une caisse avec inscription :
Dépouilles mortelles de très-excellent prince Charles de Lorraine, cardinal de Vaudémont, 81e évêque de Toul et de Plusieurs de ses proches parents.
Retirées du caveau où elles gisaient dispersée depuis leur profanation en 1792, elles ont été recueillies et déposées dans ce caveau de famille par les soins de M. l'abbé Guillaume avec le concours de MM. les administrateurs de la fondation ducale, le 30 octobre 1867
